习近平总书记指出“坚持人与自然和谐共生，坚持节约优先、保护优先、自然恢复为主的方针，像保护眼睛一样保护生态环境，像对待生命一样对待生态环境，让自然生态美景永驻人间，还自然以宁静、和谐、美丽。”为促进水生态环境的可持续利用，2007年开始，江苏省在全国率先启动了水环境资源区域补偿制度建设。2016年底，经江苏省政府同意，原省环保厅联合省财政厅印发了《江苏省水环境区域补偿工作方案》，确定112个补偿断面，按照“谁超标、谁补偿，谁达标、谁受益”的原则在全省范围实施双向补偿。通过流域上下游横向生态补偿等方式，共同推动流域的生态环境保护和治理。
江苏省位于我国东部沿海中部，北接山东，西连安徽，东南与上海和浙江毗邻，东濒黄海，地处长江、淮河流域下游，共有长江、太湖、淮河、沂沭泗四大水系，水系复杂，水环境治理难度大。按照国家“水十条”要求，江苏省对重要且具有代表性的断面进行考核，从区域行政考核出发倒逼地方行政主管部门重视水环境治理；建立水环境生态补偿机制，利用区域经济奖惩倒逼地方行政主管部门积极改善区域水环境质量。两项政策相辅相成，共同组成保障江苏省水环境持续改善的“利剑”。
江苏省水环境区域补偿政策实施以来，取得了显著的成效。2016至2020年，纳入政策范围的112个补偿断面的达标率从60%左右提升至91.7%以上，高锰酸盐指数、氨氮、总磷浓度逐年降低，2020年较2016年分别下降了4.0%、58.5%和39.1%，对江苏生态文明建设发挥了积极的作用。
2021年，已经迈入“十四五”发展规划，对照深入打好污染防治攻坚战和江苏省生态环境高质量发展新要求，原补偿方案在断面设置和水质目标等方面还存在一些不足，亟需完善。为了适应新形势，省生态环境厅联合省财政厅对水环境区域补偿工作方案重新调整，经省政府同意，今年5月1日起将正式实行。新方案覆盖更广、要求更严、创新更多，主要改变在于：
按照“十四五”国省考断面体系，结合重点交界区域，将原112个补偿断面增加至245个。同时，兼顾了地区的平衡。
陆域河流断面基本都按Ⅲ类目标执行；将太湖流域所有河流、洪泽湖主要入湖河流总磷指标由Ⅲ类标准限值进一步收紧；为遏制太湖流域水体富营养化，将总氮纳入太湖流域水环境区域补偿考核因子。
为进一步提升经济倒逼效应，按照超标倍数逐步提高至75万元、125万元、200万元，较原方案增幅约60%。
取消补偿断面连续达标奖励，更加注重改善激励。对国考断面和饮用水源地不再仅仅按照达标即奖，而是加大了对水质改善，以及水质达到Ⅱ类甚至Ⅰ类断面的奖励力度。
引入“上游无过错举证”的仲裁方式。在省财政净受偿资金有结余时，根据县（市、区）地表水环境质量排名情况和排名进位情况，适时进行奖励。
2021年5月1日起施行的《江苏水污染防治条例》中已经明确提出实行水环境区域补偿的要求，下一步江苏生态环境系统将认真贯彻《条例》和新方案的有关要求，通过经济倒逼手段，督促各地加大水污染防治力度，促进全省水环境质量持续改善，为建设美丽江苏奠定坚实基础。
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